国家标准《单细胞测序样本采集与处理规范》征求意见
【化工仪器网 标准发布】近日,国家标准计划《单细胞测序样本采集与处理规范》已完成征求意见稿,目前正公开征求意见。该文件由?TC559(全国生物样本标准化技术委员会)归口,主要起草单位为深圳华大生命科学研究院?。意见征集截至2022年12月20日。
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目前广泛应用的二代测序(NGS)技术,是基于整个细胞群体的分析,不能观察细胞的异质性。单细胞测序(SCS)则是在单个细胞水平上,对基因组或转录组进行扩增并测序,可实现在单细胞水平对疾病和生物学过程中的遗传学特征进行研究。经过10余年的发展,单细胞测序技术在肿瘤、生殖、免疫等等许多生物医学领域研究中都取得了众多成果。
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制备单细胞悬液是单细胞测序实验和数据分析的基础。制备流程主要分外周血样本、组织样本、贴壁细胞三种样本单细胞悬液制备基本流程。对于大多数类型的细胞,单细胞悬液的制备并不困难,但悬液的质量主要取决于实验人员的操作水平。在悬液制备过程中,细胞活性、组织类型、杂质量等都将影响悬液的最终质量。同时单细胞分选有多种方法,实际使用时需根据样本的实际情况和研究目的来选择合适的方法。
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目前单细胞测序领域尚无相关的标准,对于单细胞测序样本的采集和处理缺 乏系统的设计和规范,无法保证采集和处理方法的重复性和稳定性,进而无法保 证经处理的样本符合最终的使用要求。
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《单细胞测序样本采集与处理规范》规定了单细胞测序样本采集与处理的基本要求。主要技术内容包括单细胞测序的样本采集、不同样本类型预处理方法选择、处理过程、相关技术指标及保存运输要求等。适用于人和动物血液与组织、植物组织、细胞系及其他特殊单细胞测序待检样本的采集与处理。
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该标准的制订提供了统一的单细胞测序样本预处理方法指南,有助于促进单细胞测序推动我国基础研究的发展,提升我国在生命科学研究的整体创新能力和国际竞争力。