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PepSeq为抗体分析提供了庞大的平台


研究人员现在可以使用不到一微升的血浆或血清,使用一个名为 PepSeq 的可定制实验室平台来观察微小样本如何与数十万个蛋白质构建块相互作用。相关研究成果发表在Nature Protocols上。该研究使用 PepSeq 分析抗体反应的说明。该技术已被用于分析新冠疫苗产生的抗体,以及其他应用。

该平台首先设计一个感兴趣的肽“库”——作为蛋白质构建块的短氨基酸串。然后将每个肽链接到一个独特的 DNA 标签,这使科学家能够查明样品中哪些抗体(或其他蛋白质)针对哪些肽。?

这种类型的传统分析通常一次只能跟踪抗体对一个肽靶标的反应,但 PepSeq 将这种能力扩展到数千或数十万个靶标。?

研究人员说,将肽与 DNA 联系起来的技术可以追溯到很久以前,但真正是下一代测序的发展使我们能够重新利用肽-DNA 连接,并使用它来大规模生成定制内容的分析,例如新冠病毒。

创建一个 PepSeq 库大约需要两个月,其中大部分时间涉及设计阶段,只有两到三周的实验室工作。获 取 更多硬科技?前沿访问:https://byteclicks.com

研究人员希望扩展 PepSeq 系统,为文库创建更长的肽。目前,大多数肽的长度约为 30 个氨基酸,尽管科学家们已经创造出长度为 64 个氨基酸的肽。?

研究人员认为下一个前沿领域是将其扩展到数百个氨基酸并开始制造全长蛋白质或结构域,这可能使我们能够确定目前无法看到的反应的各个方面。

研究人员一直在使用该平台探索感染人类的??所有病毒,并寻找 PepSeq 可能成为开发为一种监视工具,用于检测动物病毒何时传播到人体内。?

研究人员还有一个正在进行的项目,旨在研究抗体对感染人类的??细菌的反应,以及一个以个性化癌症免疫疗法为中心的项目。

这项技术非常适合筛选这种广泛的多样性。

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